三方物流公司是指独立于货主和承运人之外的专业物流企业，既不直接与货主签订运输合同，也不具备承运人的既有运输能力，而是在运输过程中起到中间环节的连接作用。三方物流公司在物流运输过程中，既需要承担运输成本，也需要承担仓储成本。因此，运输成本是否包含仓储费用，要根据具体情况进行分析和判断。

三方物流公司的运输成本包括以下几个方面：

(1) 运输成本：指运输过程中所需的直接运输费用，主要包括车辆租赁费、燃料费、司机工资、高速公路费等。

(2) 保险费用：指对货物损失或损坏进行的保险费用。

(3) 人力成本：指为实现运输目标所需的人力成本，包括运输调度人员工资、信息化系统维护人员费用等。

(4) 管理费用：指公司垂直管理层次所需的费用，包括管理费用、办公费、水电费等。

三方物流公司的仓储成本包括以下几个方面：

(1) 仓储租赁费：在运输过程中，需要将货物进行暂时存储，因此，需要支付仓储租赁费。

(2) 仓储设备费：为保障货物的存储安全，需要购置仓储设备，如货架等。同时，还需要安装温湿度控制设备，保证货物存储环境的适宜性。

(3) 人力成本：为保证货物的质量和安全，需要设置仓储管理人员、保安人员等，对货物进行监管、保护、维护等工作。

(4) 管理费用：包括对仓储设施进行检测、维护等费用。

综上所述，三方物流公司的运输成本和仓储成本是两个不同的概念，具体是否包含仓储费用，要根据不同的情况而定。

三方物流公司在运输过程中具有以下几个特点：

(1) 分工明确：三方物流公司在运输过程中，根据其所承担的角色和职责，主要负责中间流通和调度等任务，不直接承担运输服务成本和风险。

(2) 专业性强：三方物流公司具有独特的物流服务专业知识和经验，能够为客户提供全方位的物流服务。

(3) 效率高：由于三方物流公司实现了物流业务的专业化和流程化，能够提高运输效率、降低成本，提供快速、稳定和优质的物流服务。

(4) 灵活性强：三方物流公司可以依据客户的需求和具体情况，提供个性化定制的物流服务，具有较大的灵活性和适应性。

(5) 风险分散：由于三方物流公司承担的风险较小，可以根据客户需求，采用多种运输方式，实现风险的分散。

三方物流公司的运输成本和仓储成本是否合理，要根据公司的实际情况进行分析评估，具体有以下几个方面：

(1) 运输成本是否合理：要根据运输公司的运输能力、车队配置、运输路线等情况，评估其运输成本是否合理。如果运输成本过高，可能降低公司的竞争力。

(2) 仓储成本是否合理：要根据公司的规模、仓储设备、人员配置等情况，评估仓储成本是否合理。如果仓储成本过高，可能降低公司的利润率。

(3) 运输效率是否高：要根据公司的信息化技术和物流设施，评估运输效率是否高，如果运输效率低，可能降低公司的服务水平和竞争力。

(4) 仓储安全性是否高：要根据公司的仓储环境和管理制度，评估仓储安全性是否高。如果仓储安全性低，可能会损失客户的信任和公司的声誉。

(5) 成本控制是否有效：要综合考虑运输成本和仓储成本，评估公司的成本控制是否有效，如果成本控制不力，可能会导致公司亏损。

综上所述，三方物流公司的运输成本和仓储成本是两个不同的概念，具体是否合理要根据公司的实际情况进行分析评估。需要针对不同的情况，制定相应的成本控制策略和优化方案，以提高运输效率、降低成本、提高服务水平，赢得客户的信任和支持。