处理物流运输中的保险理赔纠纷，以确保货物权益的关键是建立有效的理赔流程和清晰的责任划分，同时加强信息共享和通信，以便及时处理纠纷，并保证货物权益。

一、建立有效的理赔流程：

1. 合同约定：在物流供应链合作伙伴之间建立合同约定，明确保险责任、赔偿标准和理赔流程等事项，确保各方在发生保险事故时有明确的权利和义务。

2. 理赔申请：货物受损或丢失的一方应及时向保险公司提交理赔申请，提供必要的证据和相关文件，如货物清单、运输合同、损失照片等。

3. 理赔受理：保险公司应在收到理赔申请后进行审核并确认受理，同时向货物运输方和保险赔偿方发出受理通知，并说明后续处理流程。

4. 理赔调查：保险公司会派员进行理赔调查，包括对货物受损或丢失的情况进行现场勘察、询问相关当事人，并收集有关证据和证明材料。

5. 理赔决定：保险公司会根据理赔调查的结果和相关合同条款，对理赔申请作出决定，决定包括是否受理、赔偿金额和支付方式等。

6. 理赔支付：经过决定后，保险公司应及时向受损方支付理赔款项，并将相关支付信息通知货物运输方和保险赔偿方。

7. 纠纷解决：如果货物运输方或保险赔偿方对理赔决定有异议，可以提起申诉或诉讼，通过法律途径解决纠纷。

二、清晰的责任划分：

1. 运输责任：明确运输公司对货物的运输责任，包括货物装卸、运输过程中的风险等，通过合同约定各方的责任和义务，减少纠纷的产生。

2. 保险责任：明确保险公司对货物损失和丢失的赔偿责任，通过合同中明确标明赔偿标准和范围，减少理赔纠纷的发生。

3. 第三方责任：在货物运输过程中，如存在第三方的过错导致货物损失或丢失，应对第三方进行追偿，通过合同明确第三方责任，减少争议。

三、加强信息共享和通信：

1. 实时通信：货物运输方、保险公司和物流供应链合作伙伴之间建立良好的信息共享和通信机制，及时分享货物运输过程中的重要信息和理赔进展情况。

2. 音视频证据：通过安装摄像头和录音设备等，收集车辆行驶轨迹和货物状态的实时信息，作为理赔纠纷处理中的证据依据。

3. 数据共享：各方共享货物运输数据，包括实时定位、温湿度、压力等监测数据，以便在发生纠纷时可以快速定位问题并解决。

四、应急预案和纠纷解决机制：

1. 应急预案：建立完善的应急预案，包括事故发生时的紧急处理措施、信息通知渠道和相关人员的应变措施，以及联系法律、保险专业人士的渠道。

2. 第三方调解：对于理赔纠纷，可以引入第三方专业机构进行调解，采用中立、公正的方式协商解决争议，减少法律诉讼的成本和风险。

3. 法律诉讼：如果无法通过调解解决争议，可向法院提起诉讼，通过法律途径进行争议解决。在进行法律诉讼前，应征得法律专业人士的意见，并收集相关证据和文件以支持主张。

综上所述，处理物流运输中的保险理赔纠纷，保证货物权益需要建立有效的理赔流程和清晰的责任划分，加强信息共享和通信，同时制定应急预案和纠纷解决机制。通过规范和有效的管理，可以最大限度地保护货物权益，并尽量减少纠纷的发生和风险的扩大。